針對民國115年度中央政府總預算並未編入《軍人待遇條例》部分修訂內容，國防部表示，行政院已向憲法法庭聲請釋憲及暫時處分，基於行政一體原則，將依行政院指導辦理。行政院強調，有效落實政府照顧國軍官兵政策，始終為國防施政重點；總統賴清德日前主持將官晉任授階典禮時亦表示，若釋憲結果合乎憲法，將追溯補齊；若確定違憲，政府也會持續完善官兵的待遇制度。
此案緣起，是立法院今年6月三讀通過《軍人待遇條例》修正案，改變該條例第5條和第6條條文。前者主要是將原條文的4種加給增加為7種加給，同時規定須隨消費者物價指數累計成長率達3%時適度調整。然而，媒體矚目焦點是「對志願投入軍旅者每月新臺幣三萬元加給之」規定；後者修正內容其實是規定義務役現役軍人「待遇總額不得低於最低工資法所定之最低工資」。
立法院通過修正案後，行政院認為窒礙難行，遂依民主憲政程序於8月22日向憲法法庭聲請釋憲及暫時處分。歸納而言，行政院提請釋憲的理由主要包括：一、考量不同公務員的公平性、衡平性，且認為修法有違憲疑慮；二、修法違反憲法權力分立與責任政治；三、短時間內二度加薪，將造成軍警文職併用的機關，薪資結構失衡，對於公務人員退休撫卹制度也會出現不合理的差別待遇；四、35年前立法院也曾決議，要求行政院加發半個月公教人員年終工作獎金，當時行政院亦聲請釋憲，該決議最終被司法院大法官宣告違憲。
由上述說明可知，《軍人待遇條例》增加軍人薪資，之所以未納入115年度國防預算編列，是因為行政院與立法院對該案有不同的理解和立場，而國防部必須依法行政。目前與《軍人待遇條例》修法相關的法律主要有二，一是《國防法》，依據該法第10條：「行政院制定國防政策，統合整體國力，督導所屬各機關辦理國防有關事務。」國防部為行政院所屬機關，受到行政院督導，基於行政一體原則，國防預算編列必須依行政院指導辦理。
另外則是《憲法訴訟法》，該法第43條規定：「聲請案件繫屬中，憲法法庭為避免憲法所保障之權利或公益遭受難以回復之重大損害，且有急迫必要性，而無其他手段可資防免時，得依聲請或依職權，就案件相關之爭議、法規範之適用或原因案件裁判之執行等事項，為暫時處分之裁定。」第52條規定：「判決宣告法規範違憲且應失效者，該法規範自判決生效日起失效。」目前行政院已提請憲法法庭裁定「暫時處分」，而釋憲之結果未定，若憲法法庭判決違憲，則修法內容將失效，故不宜將尚待確定之軍人薪資調整先行編入預算。
雖然立法院與行政院對修法之立場不同，但兩院對於提高軍人薪資與福利立場實屬一致。事實上，賴總統在許多場合都表示，一定會提高軍人待遇與社會地位，並將宣示落實於行動。今年4月、6月與7月，政府分別調升國軍志願役加給、戰鬥部隊加給、網路戰加給、電偵加給及戰航管加給。若再將時間向前推，自民國105年起，包括軍人在內，軍公教已4次調薪，合計達14%，都是政府與行政團隊實質增加官兵薪資、具體落實照顧國軍官兵的行動。
除了薪資所得，政府也不遺餘力提升軍人福利與社會地位。近來最具體的措施是賴總統指示交通部與航空公司接洽，未來能讓軍人享有升等禮遇，且將軍眷列入下一階段研議對象。此一政策已獲得包括華航、長榮、星宇等航空公司正面回應，在9月3日軍人節當天實施。其實，包括美國在內的部分西方國家也有相同政策，這些國家都重視軍人貢獻與地位，凸顯我國對軍人的照顧與世界先進國家一致。
目前《軍人待遇條例》修法進入釋憲，是否加薪短時間內難以明朗，但不會影響政府對軍人的照顧。賴總統表示，未來若大法官釋憲結果合憲，政府將依法追溯補齊；若確定違憲，會在兼顧國家安全、財政負擔及整體經濟發展前提下，依照部隊任務性質，持續完善官兵待遇制度；國防部也表明將持續推動漸次提升軍人薪資、改善住用環境，同時加速武器裝備汰舊換新，落實實戰化訓練，以提升官兵士氣，踐履維護國家安全的使命。
《軍人待遇條例》修法已成為《憲法訴訟法》中的「機關爭議案件」。雖然行政與立法兩院立場不同，但均循憲政程序解決爭議，這也是我國民主政治成熟的表現。另一方面，政府、朝野與社會對軍人待遇與福利的重視，也顯示這場憲法官司無論結果如何，軍人都是贏家。